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現在普遍流傳的陰陽雙魚圖，是在宋朝才出現，淵源自道家內丹修練的圖解，明代才定型為今日常見的八卦陰陽太極圖。
源自道家的無極圖
宋朝：邵雍輾轉傳承自陳摶的八卦圖開始分「先天」和「後天」，並分別假託是伏羲和周文王所作，因此又分別稱「伏羲八卦」和「文王八卦」。朱熹開始在《周易本義》中收錄這些圖。（資料來源：易學網 | 現代的八卦圖怎麼來的？真的是伏羲畫的嗎？）
依朱彝尊《曝書亭集》考證：魏伯陽 –> 鍾離權–> 呂洞賓–> ….陳摶–> 穆脩–> 周敦頤
可知本圖與邵雍的先天易學同樣都是源自本門（文始派）陳摶祖師。
圖中的取坎填離：心陰下降，腎陽上升，為水火既濟。
闡述後天返回先天
參考楊儒賓 〈悟與理學的動靜難題〉（《國文學報》第52期，國立臺灣師範大學國文學系，2012年12月）一文所述，這張圖的圖左（由上往下）是「宇宙本體論」：從世界源頭的本體開始敘述起，接著兩儀、五行、萬 物諸階段，依序衍化，世界於是一體豐富地展開。
這張圖的圖右（由下往上）則是「玄門的修煉工夫」：指示學者如何透過身心能量逆返的過程，轉化現實人格的存在狀態，直契本源的「無極」境界。
宋代理學家周敦頤《太極圖說》
「無極而太極。太極動而生陽，動極而靜；靜而生陰，靜極復動。一動一靜， 互為其根。分陰分陽，兩儀立焉。陰變陽合而木火土金水，五氣順布，四時行焉。五行一陰陽也，陰陽一太極也，太極本無極也。五行之生也，各一其性。無極之真，二五之精，妙合而凝。乾道成男，坤道成女。二氣交感，化生萬物。萬物生生，而變化無窮焉。」
「陰陽魚」之為「象」
《莊子．則陽》：「天地者，形之大者也； 陰陽者，氣之大者也。」
《莊子．天下篇》：「《詩》以道志，《書》以道事，《禮》以道行，《樂》以道和，《易》以道陰陽。」
黑白對稱：各佔有一半的空間，象徵著陰陽的平等，一切事物平等存在。
相互環抱：不同事物之間相互關聯、相互滲透、相互依賴。沒有獨立的陰，沒有獨立的陽，抱成一圓形整體旋轉運動
魚有相反顏色的眼睛：沒有純粹的陰，也沒有純粹的陽。陰中有陽，陽中有陰。
兩魚包含在一個圓內：圓象徵著宇宙，是一個有機的整體。陰陽互為條件，相互需要、相互補充。對立的事物之間沒有絕對的界限，陰陽互相定義了對方。
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